台湾成功大学 蛋白质研究课程
课程授课大纲及内容:
蛋白质体学研究的相关技术有蛋白质分离、质谱分析、生物信息、蛋白质数组等,目前被认为研究蛋白质体最成熟的工具是二维凝胶电泳(two-dimensional gel electrophoresis, 2D-GE)的分离机制加上质谱仪(mass spectrometry, MS)的蛋白质身份鉴定(protein identification)。二维凝胶电泳利用等电位点聚焦(iso-electric focusing, IEF)与SDS-PAGE (sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel electrophoresis)两种原理,能将直接从组织或培养细胞萃取出来、成千上百的蛋白质混合物作高分辨率的分离。经过比较正常与有疾病的组织或细胞(或是在实验室内比较控制组与实验组)之二维凝胶电泳结果,看的出有变化的蛋白质就可以用质谱仪来作身份鉴定。
质谱分析技术能对大量蛋白质进行灵敏度极高的身份鉴定,它的发展革命性地改变了科学家研究蛋白质体的方式。利用质谱仪来鉴别蛋白质的原理牵涉到如何将质谱仪得到的数据与蛋白质或基因序列数据库作高效率的比对,经由比对过程找到该蛋白质与基因数据库中某一个(或多个)基因的对应关系。所需利用的质谱仪设备又可以分为介质辅助雷射脱附游离法(matrix-assisted laser desorption ionization,MALDI) 与电洒游离法(electropsray ionization,ESI)两种,目前该两种质谱仪所能提供的数据各有优势,且具有互补性。