1999年:
1. 基因组计划:
2. 端粒酶:
3. 磷酸戊糖途径:
4. 芳香族氨基酸:
5. 活性蛋氨酸(Sam)
6. 如何通过核酸序列推测未知蛋白质的氨基酸序列？
7. 核酸变性－复性和核酸紫外吸收特性的化学本质及其在生物学研究中的应用？
8. PIP2信号传导途径？其第二信使是什么？
9. DNA以何种方式复制？如何保证复制的忠实性？
10. 体内ATP生成的两种主要方式？在真核细胞中生成部位？如何转运至胞质？
11. 磷脂酰肌醇透膜传导机制及第二信使。
12. 蛋白质组与基因组的比较？
13. Ras/MAPK途径
14. Anfinsen理论（一级结构决定高级结构）

2000年：
1． Tm值：
2． 核小体：
3． 胰岛素原和胰岛素：
4． 分子伴侣：
5． 复制子：
6． DNA芯片：
7． 亮氨酸拉链：
8． 蛋白质二维电泳：
9． 讨论酶活性中心及催化活性的结构要求？金属离子对酶催化反应有什么重要作用？
10． 何谓呼吸链？其五种主要成分是什么？指出体内生成ATP的主要方式及调节机制？
11． 比较原核生物与真核生物基因组结构的不同，并指出真核生物细胞的RNA内含子剪接的主要方式。
12． 激活酪氨酸蛋白激酶通路的配基类型及其作用区别；讨论信号转导通路中MAPKinase的地位
13． 概述蛋白质分子进化有哪些规律？

2001年：
1． 超二级结构:
2． 蛋白质组：
3． 真核细胞蛋白降解途径：
4． Zinfinger：
5． 酶活性中心与不可逆抑制剂：
6． 氧化磷酸化与解偶联：
7． Coding strand与Antisense strand：
8． 融合蛋白：
9． 自1869年发现核酸以来，在核酸结构与功能研究的历史进程中，举出5项以上具有里程碑意义的重大发现。
10． 抗体在蛋白质分析实验的哪些方面派上用处？
11． 试述真核基因的结构特点：真核与原核基因转录存在的差异。
12． 指出TPK结构受体的分子结构特点，指出TPK信号转导的两条主要途径。
13． 在细胞线粒体内和线粒体外的生物氧化过程有什么不同？写出呼吸链5种组成成分。